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以后沉清云与方以智、王介之、管嗣箕，甚至后来的王夫之、陈贞慧等人形成了这样的关系，就像是亚里士多德与他的学生，亚里士多德提出观点，他的学生去想法验证。
不同点在于亚里士多德的观点绝大部分被他的学生验证为错的，而沉清云所教的却被验证为是对的。
而数学与自然科学就是这样越往后越是深奥，也越是吸引真正的做学问的，而随着学问的深奥，也让学生对传道授业着越发尊重。方以智、王介之、管嗣箕就是如此。
而且当以后方以智与汤若望、毕方格接触后，发现沉清云所教的数学、物理学、化学远深于西学，震惊之余，怀疑之后，从沉清云那里得知后面是沉清云自推的答桉后，方以智等对沉清云更是推崇备至。
如此又过了三天，在沉清云讲到二元一次方程时，方以智才想到他该去蕺山了，不然他父亲那里一关他过不去，而且快到年底，也该回去过年，于是这才提出告辞。
而方以智既然要去，出于同样的原因，王介之、管嗣箕也告辞而去。
十一月二十日清晨，小雪洋洋洒洒的下着，一大早方以智、王介之、管嗣箕分别找上了沉光远、沉延易、沉清林分别说了些多有打搅，非常感谢的话，然后才被沉清云送了出去。
“多谢沉兄弟赐教，密之收益非浅。真想住在你这儿。”
“我也想住在这儿，不想走了。”王介之很耿直的说道。
“哈哈，我也不想走。”
临出门之际方以智、王介之、管嗣箕分别说道。而柳如是在廊下，还是那句话她的性子里有“倚门小妇”的性子，喜欢小门一闭成一统，清净自在。这整天熙熙攘攘的，还要帮他们提水提茶、收拾饭桌的，在过了两天的传道授业的瘾后，她早已烦了，因此闻言大骇。
而这时沉清云的声音清晰的传入了他的耳里：“三位兄台客气，有闲你尽管来就是。”
随即是方以智、王介之、管嗣箕斩钉截铁的声音：“一定！”
“一定！”
“一定！来年一定过来为沉兄弟贺！”
“多谢吉言。”
……
“沉兄弟学识真是渊博，这趟算是开了眼界。”回去的路上，方以智与王介之、管嗣箕叹道。
“难为他小小年纪，学识就如此渊博，汇通中西。”
“只是此非科考之学，又牵扯精力……”
“他年纪尚幼，倒也无妨。”
“哈哈，如此说来我最后的话有些不当了。”
“也不一定。”
……
时下的士子都喜欢议论朝政、裁量人物，复社里的人更是这方面的佼佼者，一路三人一边评论着沉清云，一边往金陵而去。
只是沉清云最后所讲的物理问题依然在他们的脑海里翻腾着——水结冰的本质是什么。